Desde el segundo semestre del año 1996 la empresa Lucchetti, una empresa de pastas y tallarines del grupo económico Luksic, comenzó a construir una fábrica frente al área protegida.
Una vez iniciadas las primeras obras visibles de las instalaciones, los vecinos alarmados comenzaron sus reclamos por el riesgo que significaba una industria de envergadura en las inmediaciones de los pantanos.
El Municipio de Lima y organizaciones ambiéntales denunciaron tratando impedir la construcción de la planta de pastas de Lucchetti. Muchas fueron las aristas de este conflicto, que terminaron con el cierre definitivo e la fábrica.
El Alcalde Luis castañeda recibió una copia del informe sobre la situación ambiental de los pantanos de Villa, elaborado por la unión Mundial para la Naturaleza (UICN) y que la anterior administración, mantuvo en reserva.
Según el estudio, a salida de Lucchetti era de “alta prioridad”. Sin embargo hay otras industrias asentadas a los adrededores en la zona de amortiguamiento del área protegida son 3M( material de oficina que cuenta con un gran almacén, mimosa Kimberly (pañales,papel,etc) , Globe Natural (cosméticos y productos naturales), además de muchas industrias informales de diversa índole sobretodo en los asentamientos humanos del cerro.
Sin embargo, es importante destacar, que es frecuente escuchar expresiones de resignación, preocupación y tristeza ante la presencia de agresiones ambientales sea por parte de las empresas industriales o de otros actores.
No se oponen, aceptan que es un proceso irrevocable y empiezan a considerar que las acciones posiblemente dañinas, cometidas por ellos en el pasado, puedan haber tenido algún nivel de impacto sobre el ecosistema de los "Pantanos de Villa". Pero desean que se logre conservar.
a. Situación actual:
Podemos empezar señalando diversos peligros actuantes en la zona:
a1. La presencia del ex-relleno sanitario ocupado hoy por el A.H. "Susana Higuchi", que aún permanece contaminando la napa freática.
a2. La posible explosión de los tanques de gas licuado de petróleo del llamado "Grifo Ecológico" que arrasarían con buena parte de los "Pantanos de Villa".
a3. La utilización de las corrientes de agua para las tareas de curtiembres informales, cuyos materiales (tintes, taninos, etc.) son contaminantes.
a4. La costumbre de diversos pobladores de bañarse y lavar su ropa en los canales y puquiales con lejía y detergente que los afecta negativamente (se supone que las lavanderías instaladas y recientemente inauguradas en las cercanías del manantial reducirán ese riesgo)
a5. Como una parte significativa de las viviendas no poseen instalaciones de desagüe y como las costumbres de un cierto porcentaje de pobladores incluyen la defecación al aire libre, la contaminación e infiltración de las aguas con heces fecales, es en un hecho permanente.
a6. Aumento del pH de las aguas por vertido de desmonte.
a7. Ruidos de tráfico vehicular en la carretera, incluyendo el ruido ocasionado por clubes provinciales y clubes privados, cuando realizan sus fiestas de fin de semana.
